胃酸の分泌を抑える制酸剤（Ｈ２ブロッカーやプロトンポンプ阻害剤）と胃の粘膜を保護する薬が投薬の基本となります。
このほか症状に応じて痛み止めやストレスをとる安定剤などが追加されます。
胃・十二指腸潰瘍では、高率にピロリ菌が原因になっているため、陽性が判明すれば１週間、除菌薬を飲んでピロリ菌を殺菌するようにします。