C型肝炎ウイルスはそれが持っている遺伝子の違いにより主に1a、1b、2a、2bなどのタイプに分類されています（これを遺伝子型＝ジェノタイプといいます）。
日本人に多いのは1b型で約70％、2a型、2b型がそれぞれ20％、10％程度で、1a型はほとんどみられません。
残念ながら、1b型はインターフェロンが効きにくいタイプとされています。